Alexa用户最常遇到的问题之一是自己网站的排名不稳定，上下浮动很大。另一个问题则是当自己的网站得到了更多的流量时，却发现Alexa排名反而下降了。这两个问题的原因在于两个方面。首先，所有网站是按网站间流量的相对大小进行排名。其次，长尾理论也会导致网站排名不稳定。长尾理论指的是在分布这种现象下，往往很少的事物占据了绝大部分的概率，而婆罗大众中的个体却只有很小的概率。在Alexa排名中，超过10万名的网站就可以被视为“长尾”。此外，虽然Alexa仅考虑安装有Alexa工具条的人访问网站的数量，但是这个数字可能远远小于实际网站的访问量。因此，排名的变化可能并不代表实际的流量变化。