工程款的纠纷必须在三年内提起诉讼，但在特殊情况下可向法院申请适当延长。起诉时限从权利人知道或者应当知道权利受到侵害之日开始计算，如果超过20年，人民法院将不予保护。

以上法律规定来源于《民法典》第188条，其中明确规定向法院请求保护民事权利的起诉时限为三年，但有法律另有规定的情况，需按照其规定。一般情况下，起诉时限从权利人知道或应当知道权利受到损害之日开始计算，但超过20年的不予保护。如果有特殊情况，人民法院可以视情况延长起诉时限。

在工程款的取得过程中，首先需要确认的是合同有效性的问题。由于建筑市场中存在挂靠、借用资质等违规行为，导致一些施工合同无效。所以，在施工单位的立场上，需要了解并遵守相关法规，同时对于合同的无效，如建设单位未提出异议或工程质量合格，也可参照合同要求取得工程款。

另外一个问题是合同相对行的问题。由于挂靠、借用资质以及转包情况较为常见，如果要申请工程款，必须与业主建立直接的合同关系或持有效授权委托。否则，业主有权拒绝支付工程款。