登录方式和功能不同。
1、登录方式不同，微信PC版不需要安装软件，可直接登录，微信Windows版需要安装电脑版软件进行登录操作。
2、功能不同，两个版本都有聊天功能，微信Windows版可以显示与联系人的聊天记录，并可以记录聊天信息进行备份，而微信PC版则不能显示手机微信客户端中的聊天记录显示的联系人。