支付宝医保电子凭证的作用还是比较大的，医保电子凭证是由国家医保信息平台统一生成的，具有一定的安全性。另外持有医保电子凭证可以直接在线上进行医保查询、参保登记以及报销支付等业务的办理。医保电子凭证是有数据加密传输的，安全性更甚于实体卡，能够避免实体卡丢失的情况。